新农村建设，一个系统工程
建设社会主义新农村是《建议》中的亮点之一，被认为是“我国现代化进程中的重大历史任务”。中国人民大学农业与农村发展学院院长温铁军解释说：“新农村的‘新’，就‘新’在农村的发展，既能体现科学发展观的要求，也能够体现和谐社会的要求。”
国务院发展研究中心农村经济研究部副部长徐小青指出，提出新农村建设是基于两个判断：第一，目前我国经济社会发展的二元结构特征还非常明显，要达到2020年全面建设小康社会目标的重点难点都在农村；第二，我国现在总体上已经到了以工促农、以城带乡的发展阶段。
事实上，许多市场经济国家，在工业化达到一定阶段，都会适时提出新农村建设。温铁军说，与时俱进地把新农村建设作为解决当前中国非常紧迫的“三农”问题的一个重要方向提出来，既符合我们国家的客观需要，也符合国际上通行的规律。
《建议》中对社会主义新农村的描述一共20个字，“生产发展、生活宽裕、乡风文明、村容整洁、管理民主”。可以看得出来，新农村建设是一个系统工程，既有发展农村经济的内容，又有发展农村社会事业的内容；既有农村综合改革的内容，又有农村精神文明建设的内容。国家发改委宏观经济研究院研究员常修泽提醒说，新农村建设不能简单理解为单纯改变村容村貌，要防止在实践中将其狭隘化甚至低层化。
自主创新，一个战略课题
在《建议》中，自主创新是作为“调整产业结构、转变经济增长方式的中心环节”提出来的。在胡锦涛总书记的论述中，增强自主创新能力，还是保持经济长期平稳较快发展，建设资源节约型、环境友好型社会的“重要支撑”。很明显，提高自主创新能力是一个贯穿发展诸多方面的事情，是一个事关经济社会发展全局的战略性问题。
近年来，中国经济增长的技术含量虽然有所提高，但总的说来，科技创新能力较弱，创新技术含量不高。前不久，在世界经济论坛的全球竞争力排名中，中国的名次再一次下滑，其中技术革新指标低水平徘徊是重要原因。国家科技促进发展研究中心主任王元指出，中国要保持一个较高的增长速度，要增强国家实力，需要大幅度提高自主创新能力。
要落实自主创新的战略，就需要一系列的制度支撑。常修泽认为，需要完善和创新的制度包括：一是产权保护制度，二是风险投资制度，三是技术入股和技术期权制度，通过对创新技术的评估、作价、折股，推进“技术资本化”，给技术人员安上激励机制的“马达”。